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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
赏民俗购年货 吉庆街里品“年味武汉”******
(新春走基层)赏民俗购年货 吉庆街里品“年味武汉”
中新网武汉1月15日电 (记者 张芹)看演出、逛市集、品美食……2023“年味武汉”吉庆民俗迎春文化活动15日下午在江岸区吉庆街开启。活动现场，书法家、民间剪纸艺术家书写春联、“福”字、剪窗花赠送给市民、游客。
当日正值南方农历小年，走进吉庆街，一串串红灯笼、中国结将街道装饰一新，耳畔欢快的乐曲此起彼伏，“年味”迎面而来。德华楼、汪玉霞、冠生园等老字号店铺里，市民排起了长队。
民间剪纸艺术家现场剪窗花 张芹 摄活动现场，武汉老字号汪玉霞的现炸京果最受欢迎。66岁的李师傅从事传统汉味糕点制作已经40余年，即使已经退休，每逢春节总是会被特意请来制作京果。将糯米粉制成的面团切丁，下油锅炸至金黄酥脆，再浸泡在糖水中，而后裹满雪白的糖霜，一颗颗油香甜蜜的京果便制作而成。
“京果是武汉的传统点心，春节走亲访友待客必不可少。”李师傅告诉记者，京果是否好吃，酥脆是关键，这就考验师傅们对食材比例的控制和火候的把握。
市民购买现炸京果 张芹 摄当日，武汉市民李英带着孙子前来采购年货。她告诉记者，吉庆街是武汉传统老街，汇聚了众多武汉老字号，虽然现在各种口味的点心层出不穷，但逢年过节总少不了来此寻寻武汉的老味道。
“这里‘年味’很浓，到处都是喜庆的氛围。”来自河南的李丹妮已在武汉游玩一周，返程前特意找出“攻略”直奔吉庆街选购伴手礼。
书法家为市民、游客写春联 张芹 摄江岸区文化馆工作人员曹景告诉记者，今年迎春文化活动从腊月二十四小年开始，一直持续到正月十五，市民、游客不仅可在此品尝地道武汉美食，选购特色年货，还能欣赏到丰富多彩的文艺演出及非遗技艺。其间，还将举行威风锣鼓、舞龙舞狮、请财神送福禄、猜灯谜、闹元宵等民俗活动。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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